- DOI:
10.13738/j.cnki.acc.qklw60536
- 专辑:
科学Ⅰ辑;信息科技
- 专题:
信息、科学;综合科技
- 分类号:
G90;N92
摘要:目的:评估结直肠癌(RC)患者中驱动基因突变以及微卫星不稳定性(MSI)与阻塞性睡眠呼吸暂停(OSA)患病率的相关性。方法:本研究共纳入192例自 2020 年 1 月 1 日至 2020 年 12 月 31 日于惠州市中心人民医院病理确诊为CRC的患者,收集临床病理特征,使用下一代测序技术(NGS)进行基因检测,使用可穿戴血氧仪记录睡眠相关指标。以血氧饱和度指数(ODI)≥5作为OSA的诊断标准,分析CRC患者中驱动基因突变以及MSI状态与OSA患病率、睡眠指标的相关性。结果:192名CRC患者中OSA患病率为17.71%。与NRAS野生型患者相比,NRAS突变患者的最低血氧饱和度(LSaO2)、匹兹堡睡眠质量指数(PSQI)评分较低(P<0.05),BRAF突变与较高的LSaO2水平相关(P=0.011),而KARS突变状态与睡眠相关指标无关(P>0.05)。OSA的患病率与KRAS、NRAS和BRAF突变状态无关。MSI状态与睡眠相关指标无关(P>0.05),但与OSA患病率相关(P=0.036),低度微卫星不稳定性(MSI-L)以及微卫星稳定(MSS)患者OSA患病率更高。结论:CRC患者中,驱动基因突变状态与OSA患病率无关,而MSI状态与OSA患病相关,MSI-L或MSS患者OSA患病率更高。
关键词:驱动基因突变;微卫星不稳定性;阻塞性睡眠呼吸暂停;结直肠癌
前言
结直肠癌(colorectal cancer, CRC)是全球男性第三大、女性第二大癌症,手术仍是早期CRC患者的主要治疗方法,但约25%的患者在诊断CRC时已为晚期或发生远处转移,5年总生存率不足20%[1]。约60%的转移性CRC患者存在KRAS或NRAS基因突变,5%-10%的患者存在BRAF突变,15-20%的患者存在PIK3CA突变[2],其中KRAS和BRAF突变是预后不良指标。微卫星不稳定性(Microsatellite instability, MSI)是一种由DNA错配修复活性丧失引起的超易变表型,包括高度微卫星不稳定性(high microsatellite instability, MSI-H)、低度微卫星不稳定性(low microsatellite instability, MSI-L)和微卫星稳定(microsatellite stable, MSS),与MSS或MSI-L型CRC患者相比,MSI-H型患者预后更好[3-4]。阻塞性睡眠呼吸暂停(Obstructive sleep apnea, OSA)是一种常见的睡眠呼吸障碍疾病,其主要特征是睡眠时上气道反复塌陷导致的呼吸暂停和/或通气不足,OSA 在恶性肿瘤的发生发展中起着重要作用,与转移性CRC患者较短的无进展生存期和总生存期相关[5]。然而,MSI 状态和驱动基因突变状态是否与CRC患者中OSA患病相关,目前尚不清楚,因此,在本研究将探讨MSI和驱动基因突变状态与OSA的相关性。
研究对象与方法
1. 患者数据收集
本研究纳入2020 年 1 月 1 日至 2020 年 12 月 31 日期间在惠州市中心人民医院确诊为CRC并接受基因检测的患者。纳入标准:(1)年龄≥18岁;(2)病理确诊为CRC;(3)完成CRC相关基因检测。(4)完整的临床和随访数据。同时患有其他恶性肿瘤的患被排除在外。匹兹堡睡眠质量指数(Pittsburgh sleep quality index, PSQI)通过问卷调查获得。本研究经惠州市中心人民医院伦理委员会批准,所有患者知情同意。
2. CRC 患者中OSA患病筛查
采用穿戴式血氧仪(云卫康,中国成都)监测晚上 11:00 到早上 6:00 期间的睡眠状态。睡眠监测信息包括:总睡眠时间(total sleep time, TST)、血氧饱和度指数(oxygen desaturation index, ODI)、平均血氧饱和度(mean oxygen saturation, MSaO2)、最低血氧饱和度(lowest oxygen saturation, LSaO2)和血氧饱和度低于90%的夜间百分比(percent nighttime with oxygen saturation < 90% , Tsat90)。ODI表示短时间反复缺氧到正常状态的转变过程中产生的活性氧的数量[7],根据ODI将OSA 的诊断标准设定为 :0~5(正常)和≥5(异常)。
3. CRC患者驱动基因突变检测
使用QIAamp DNA FFP试剂盒提取石蜡包埋的肿瘤组织DNA,并使用Qubit dsDNA HS试剂盒检测DNA浓度。运用“Panel INCa”TruSeq Custom Amplicon 文库制作工具v1.5版)制备文库,使用Illumina仪器测序,采用Sophia DDM软件v.4.3版进行数据分析。
4. CRC患者MSI状态检测
微卫星标记包括6个单核苷酸重复标志物(NR21,NR24,NR27,BAT25,BAT26和MONO27)。存在2个或2个以上不稳定标志物为MSI-H,存在1个不稳标志物为MSI-L,无不稳定标志物则为MSS。
5. 统计分析
使用 SPSS 19.0 软件进行统计分析。计量资料以均数±标准差表示,组间比较采用t检验或方差分析。计数资料以百分比(%)表示,组间比较采用卡方检验。P<0.05 为差异有统计学意义。
研究结果
1. 患者临床特征
本研究共纳入192名患者,其中男性107人(55.73%),女性85人(44.27%),平均年龄为57.42±11.40岁。122名(63.54%)患者(63.54%)为结肠癌,70名(36.46%)为直肠癌,大部分患者分期为III期,占42.71%(82/192)。OSA发病率为17.71%(34/192)。
2. 驱动基因突变情况
192名患者中,90例(48.6%)存在KRAS突变,11例(5.73%)存在BRAFV600E突变,7例(3.65%)存在NRAS突变。在90名KRAS突变患者中,第12密码子突变率为55.56%,第13密码子突变率为27.78%。在密码子12中G12D突变率最高(15.10%),密码子13中只检测到G13D(13.02%),见表1。
表1. CRC患者中KRAS突变位点和突变率
基因突变类型 | 总例数 | 突变例数 | 突变率 (%) |
KRAS 基因 | 192 | 90 | 46.86 |
突变类型 | |||
Codon 12, G12D | 29 | 15.10 | |
Codon 12, G12V | 10 | 5.21 | |
Codon 12, G12C | 4 | 2.08 | |
Codon 12, G12S | 3 | 1.56 | |
Codon 12, G12A | 1 | 0.52 | |
Codon 12, G12D, G12A | 1 | 0.52 | |
Codon 12, G12D, A146V | 1 | 0.52 | |
Codon 12, G12D, G13C | 1 | 0.52 | |
Codon 13, G13D | 25 | 13.02 | |
Codon 31, E31N | 1 | 0.52 | |
Codon 35, c.35G>T | 1 | 0.52 | |
Codon 61, G61R | 1 | 0.52 | |
Codon 61, Q61H | 2 | 1.04 | |
Codon 117, G117N | 1 | 0.52 | |
Codon 117, K117N | 1 | 0.52 | |
Codon 146, A146T | 3 | 1.56 |
3. CRC患者驱动基因突变状态与睡眠指标之间的相关性
KRAS突变和野生型患者的TST、MSaO2、LSaO2、Tsat90%和PSQI评分差异均无统计学意义(均P>0.05)。与NRAS野生型患者相比,NRAS突变患者的TST更长,LSaO2、PSQI更低(P<0.05),但两组MSaO2和Tsat90%差异无统计学意义(均P>0.05)。BRAF突变患者的LSaO2明显高于BRAF野生型患者(P=0.011),但两组TST、MSaO2、Tsat90%和PSQI评分差异无统计学意义(均P>0.05),见表2。
表2 CRC患者驱动基因突变状态与睡眠相关指标的相关性
因素 | 例数 | KRAS | P | NRAS | P | BRAF | P | |||
突变型 (n=90) | 野生型 (n=102) | 突变型 (n=7) | 野生型 (n=185) | 突变型 (n=11) | 野生型 (n=181) | |||||
TST (小时) | 192 | 5.56±1.29 | 5.38±1.23 | 0.158 | 6.51±1.16 | 5.44±1.26 | 0.045 | 5.40±1.17 | 5.47±1.27 | 0.799 |
MSaO2 (%) | 192 | 95.50±2.49 | 95.01±3.02 | 0.228 | 95.29±1.80 | 95.24±2.82 | 0.965 | 96.82±1.47 | 95.14±2.82 | 0.053 |
LSaO2 (%) | 192 | 81.03±8.55 | 81.38±8.64 | 0.779 | 74.57±8.40 | 81.47±8.50 | 0.036 | 87.55±3.80 | 80.83±8.64 | 0.011 |
Tsat90 (%) | 192 | 6.94±13.75 | 9.16±18.21 | 0.347 | 4.77±4.50 | 8.24±16.55 | 0.581 | 1.59±2.89 | 8.51±16.67 | 0.171 |
PSQI 评分 | 192 | 8.79±4.74 | 7.96±4.46 | 0.214 | 4.14±1.07 | 8.51±4.61 | 0.013 | 7.82±4.85 | 8.38±4.60 | 0.695 |
4. CRC患者MSI状态与睡眠指标的相关性
MSI-H组、MSI-L组和MSS组的TST、MSaO2、LSaO2、Tsat90%和PSQI评分差异均无统计学意义(均P>0.05),见表3。
表3. CRC患者MSI状态与睡眠指标的相关性
因素 | 例数 | MSI状态 | P | ||
MSI-H (n=22) | MSI-L (n=42) | MSS (n=128) | |||
TST (小时) | 192 | 5.38±1.51 | 5.54±1.16 | 5.45±1.25 | 0.734 |
MSaO2 (%) | 192 | 95.45±3.50 | 95.32±1.90 | 95.18±2.92 | 0.890 |
LSaO2 (%) | 192 | 81.18±8.37 | 81.26±8.32 | 81.21±8.76 | 0.999 |
Tsat 90 (%) | 192 | 6.98±18.32 | 6.69±10.16 | 8.78±17.55 | 0.727 |
PSQI评分 | 192 | 7.14±4.92 | 8.74±5.00 | 8.43±4.41 | 0.395 |
5. CRC患者中驱动基因突变以及 MSI 状态与其OSA 患病率的相关性
MSI-H组、MSI-L组和MSS组的ODI ≥5患者比例差异有统计学意义(P=0.036),其中MSI-H型患者OSA发生率更低。KRAS突变组和野生组之间ODI ≥5患者的比例差异无统计学意义(P=0.709)。不同NRAS突变状态或BRAF突变状态患者之间ODI ≥5患者的比例差异无统计学意义(均P>0.05),见表4。
表4. 结直肠癌患者中驱动基因突变及MSI状态与OSA患病率的相关性
因素 | 例数 | ODI | F/c2 | P | |||||||
ODI<5 (n=158) | ODI≥5 (n=34) | ||||||||||
KRAS (n, %) | 0.162 | 0.709 | |||||||||
突变型 | 90 | 73 (46.20) | 17 (50.00) | ||||||||
野生型 | 102 | 85 (53.80) | 17 (50.00) | ||||||||
NRAS (n, %) | 1.563 | 0.357 | |||||||||
突变型 | 7 | 7 (4.43) | 0 | ||||||||
野生型 | 185 | 151 (95.57) | 34 (100.00) | ||||||||
BRAF (n, %) | 2.511 | 0.218 | |||||||||
突变型 | 11 | 11 (6.96) | 0 | ||||||||
野生型 | 181 | 147 (93.04) | 34 (100.00) | ||||||||
MSI (n, %) | 6.478 | 0.036 | |||||||||
MSI-H | 22 | 22 (13.92) | 0 | ||||||||
MSI-L | 42 | 33 (20.89) | 9 (26.47) | ||||||||
MSS | 128 | 103 (65.19) | 25 (75.53) | ||||||||
讨论
多项研究发现,OSA与较高的癌症发病率和癌症相关死亡率有关[7-8]。在西班牙的一项多中心临床队列研究中,发现OSA患者的恶性肿瘤发病率为5.3%(261/4910),其中结直肠癌和前列腺癌占大多数(分别为16.5%和16.1%)[9]。本次研究中,CRC患者中OSA患病率为17.71%,再次证实了OSA与CRC存在相关性。一项前瞻性研究发现,伴有OSA转移性CRC患者的无进展生存期和总生存期明显较短,表明OSA是预测转移性CRC患者预后不良的潜在临床标志物[5]。因此,进一步探讨OSA与CRC之间的关系尤为重要。
驱动基因突变会引发CRC的致癌转化[10],但驱动基因突变是否与OSA患病相关仍然未知。KRAS和NRAS是RAS基因家族的成员,其中KRAS是CRC中最常发生突变的致癌基因之一,KRAS突变者预后较差,但NRAS突变对CRC患者预后的影响仍存在争议[11-12]。一项荟萃分析显示,NRAS突变可能是CRC患者不良预后的指标[13]。BRAF基因突变并不常见,多项研究证实BRAF基因突变与CRC预后不良显著相关[14]。本次研究中,KRAS突变是CRC患者中最常见的突变,其突变率为46.86%,其中最常见的突变位点是密码子12(66.67%),其次是密码子13(27.78%);NARS和BRAF突变在本研究纳入的患者中并不常见,突变率分别为3.65%和5.73%,这一结果与目前报道一致。
本次研究首次探讨CRC患者中驱动基因突变与OSA患病率、睡眠相关指标之间的关系,结果显示,NRAS突变患者的LSaO2水平较低,PSQI评分较差,而BRAF突变患者的LSaO2水平较高,KARS基因突变与睡眠相关指标之间没有相关性;此外,以ODI≥5作为OSA的诊断标准时,CRC患者中OSA患病率与KRAS、NRAS和BRAF突变状态无相关性。MSI是DNA错配修复系统缺陷导致的一种独特的分子改变,MSI-H的存在预示着CRC患者具有良好的预后,在II期CRC的治疗决策中起着关键作用[4]。此外,MSI状态还能有效预测免疫检查点抑制剂对晚期CRC患者的疗效[15]。本次研究中,暂未发现MSI状态与睡眠相关指标有关,但它与CRC患者的OSA患病率有关。当以ODI≥5作为OSA的诊断标准时,MSI-H组、MSI-L组和MSS组的OSA患病率分别为0%、21.4%和19.5%,表明MSI-L或MSS患者更易患OSA,因此,我们需要在临床上进行睡眠监测,以便尽早发现和治疗OSA,从而改善CRC患者预后。
此外,我们的研究存在一些局限性,单中心回顾性队列研究中患者选择和数据收集方面可能存在偏倚,后期需要开展大型多中心的前瞻性研究,探讨CRC患者中驱动基因突变以及MSI状态与OSA患病率的相关性。
结论
CRC患者中,驱动基因突变状态与OSA患病率无关,而MSI状态与OSA患病相关,MSI-L或MSS患者OSA患病率更高。
参考文献
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基金:惠州市2021年省乡村振兴战略专项资金,项目编号:2021SC010312001,项目名称:惠州市癌症大数据调查——2016年-2020年惠州市中心人民医院恶性肿瘤发病及死因调查
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